Peptidomimetische Bausteine zur Synthese von RNA-Liganden, Fachbücher von Sven Breitung

Ein bekanntes Beispiel für regulatorische RNA-Protein-Wechselwirkung stellt der Komplex der TAR-RNA von HIV-1 und dem viralen Protein Tat dar. Dieser Komplex ist wichtig für die effiziente Transkription des viralen Genoms. Das Wissen über die Prinzipien der Erkennung von Tat zu TAR-RNA sollte es ermöglichen, spezifische Liganden zu designen, die als antivirale Tat-Antagonisten agieren können. Das Ziel dieser Arbeit war die Synthese von RNA-Liganden für die Festphasenpeptidsynthese (FPPS) basierend auf heteroaromatischen Bausteinen. Die Bindungsaffinitäten der aus der FPPS dargestellten Peptide und kleinen Molekülen zur TAR-RNA von HIV-1 wurden über einen fluoreszenzbasierten Assay und Fluoreszenz-Korrelations-Spektroskopie (FCS) bestimmt. Durch NMR-Untersuchungen und molekulardynamische Berechnungen war es möglich, eine Konformationsänderung der TAR-RNA festzustellen. Antivirale Eigenschaften der Peptide und kleinen Moleküle wurden durch einen HeLa P4-Zellassay bestimmt. Ein weiteres Ziel der Arbeit war die Untersuchung des Bindungskonzepts und der antiviralen Eigenschaften von Diaminopyrazolen und Indazolen.