Improved Scatter Search Algorithm For Predicting Protein Structures, Fachbücher von Iman Ghalayini

Das Buch "Improved Scatter Search Algorithm For Predicting Protein Structures" von Iman Ghalayini bietet eine umfassende Untersuchung eines verbesserten Scatter Search (SS) Algorithmus zur Vorhersage von Proteinstrukturen auf Atomniveau. Der Autor nutzt das CHARMM22-Energie-Modell, um die 3D-Struktur von Proteinen durch Minimierung der mit dem Falten von Proteinen verbundenen Energie-Funktion zu erzeugen. Die Methodik basiert auf der Analyse von Aminosäuresequenzen sowie auf Daten aus bekannten Proteinstrukturen, um vergleichende Ergebnisse zu erzielen. Der SS-Algorithmus wird als evolutionärer Algorithmus definiert, der eine Population von Lösungskandidaten verwendet, die über mehrere Iterationen hinweg evolutionären Operationen unterzogen werden. Diese Kombination aus intensiver Suche und Diversifikation führt zu vielversprechenden Ergebnissen, die im Vergleich zu anderen Energie-Modellen bewertet werden. Die Ergebnisse zeigen, dass der verbesserte SS-Algorithmus 3D-Strukturen mit geringen Abweichungen von Referenzproteinen erzeugt und die Vorteile des CHARMM22-Energie-Modells demonstriert.