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Computational Pipeline for Human Transcriptome quantification, Fachbücher von Guorong Xu

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Das Buch "Computational Pipeline for Human Transcriptome Quantification" von Guorong Xu bietet eine umfassende Untersuchung der Entwicklung einer computergestützten Pipeline zur Verarbeitung von RNA-Sequenzierungsdaten. In der Forschung wird die Herausforderung behandelt, grosse Mengen an kurzen Lesungen, die durch Next-Generation Sequencing (NGS) erzeugt werden, effizient zu analysieren. Ein zentraler Aspekt dieser Arbeit ist die Ausrichtung dieser Lesungen auf ein Referenzgenom, was für die Analyse von NGS-Daten von entscheidender Bedeutung ist. Das Buch stellt das Software-Tool SAMMate vor, das eine grafische Benutzeroberfläche bietet und es Forschenden ermöglicht, NGS-Daten in den Formaten SAM und BAM zu verarbeiten. Diese Software ist sowohl mit Einzel- als auch mit Paarend-Sequenzierungstechnologien kompatibel und unterstützt die präzise Berechnung von Genexpressionswerten. Die Arbeit richtet sich an biomedizinische Forscher, die eine benutzerfreundliche Lösung zur Analyse ihrer Daten suchen.

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