Computational Pipeline for Human Transcriptome quantification, Fachbücher von Guorong Xu

Das Buch "Computational Pipeline for Human Transcriptome Quantification" von Guorong Xu bietet eine umfassende Untersuchung der Entwicklung einer computergestützten Pipeline zur Verarbeitung von RNA-Sequenzierungsdaten. In der Forschung wird die Herausforderung behandelt, grosse Mengen an kurzen Lesungen, die durch Next-Generation Sequencing (NGS) erzeugt werden, effizient zu analysieren. Ein zentraler Aspekt dieser Arbeit ist die Ausrichtung dieser Lesungen auf ein Referenzgenom, was für die Analyse von NGS-Daten von entscheidender Bedeutung ist. Das Buch stellt das Software-Tool SAMMate vor, das eine grafische Benutzeroberfläche bietet und es Forschenden ermöglicht, NGS-Daten in den Formaten SAM und BAM zu verarbeiten. Diese Software ist sowohl mit Einzel- als auch mit Paarend-Sequenzierungstechnologien kompatibel und unterstützt die präzise Berechnung von Genexpressionswerten. Die Arbeit richtet sich an biomedizinische Forscher, die eine benutzerfreundliche Lösung zur Analyse ihrer Daten suchen.